Как проверить, какие сценарии запуска запускаются после подключения ssh к машине?
В двух словах..
Общесистемный с RHEL / CentOS, скрипты инициализации содержатся внутри /etc/rc.d, который является инициализацией в стиле System V.
Другие, например Slackware, используют инициализацию в стиле BSD.
Скрипты запускаются init, который настраивается в /etc/inittab.
На уровне пользователя он будет уникальным для вашей оболочки. С участием bash, оболочка по умолчанию в большинстве Linux, интерактивная оболочка будет использовать оба /etc/profile и ~/.bash_profile. Неинтерактивный будет использовать ~/.bashrc.
Здесь много деталей, и если вы хотите конкретный ответ, вам нужно будет уточнить.
В sshd(8) Страница руководства, а также страница руководства используемой оболочки сообщают, какие файлы просматриваются при входе в систему.