У меня Debian 8. Иногда, когда я запускаю команду, VPS отключался. Из логов я вижу:
Nov 14 07:22:34 localhost cron[386]: (CRON) INFO (Running @reboot jobs)
Это не ошибка. Это только указывает на то, что на вашем сервере наверное был перезапущен, и ваш демон Cron выполняет задания, запланированные с нестандартным макросом @reboot.
В @reboot определено в FreeBSD man crontab(5) так как Запускаем один раз при запуске cron. Это именование хорошо работает на практике, потому что обычно нет необходимости перезапускать Cron, т.е. запуск Cron указывает на загрузку машины. Однако, если Cron действительно был перезапущен, вам нужно будет посмотреть на другой syslog линии до и после этого, чтобы быть уверенным. Или беги last -x shutdown reboot.