Когда я выбираю Use automatic configuration script
и укажите его в pac-файл наших прокси, не станет ли настройка прокси внизу неактивной?
Если вы отметите «Автоматически определять настройки» и «Использовать сценарий автоматической настройки», автоматическая настройка будет иметь приоритет над настройками вручную.
Итак, краткий ответ на ваш вопрос: да
С уважением