Можно ли подписать один пограничный сервер с Exchange 2010 Service Pack 3 на несколько сайтов AD? Или можно подписаться только на один сайт?
Нет.
Один или несколько пограничных транспортных серверов могут быть подписаны на один сайт Active Directory. Однако пограничный транспортный сервер нельзя подписать более чем на один сайт Active Directory. Если у вас развернуто более одного пограничного транспортного сервера, каждый сервер может быть подписан на другой сайт Active Directory. Для каждого пограничного транспортного сервера требуется индивидуальная пограничная подписка.