В Gentoo в чем разница между mysql, mysql-community, и mysql составлено с --enable-community-features?
Это разделение просто отражает запутанное именование MySQL. Посмотрите их история изменений для 5.0 чтобы увидеть, что произошло.
Все последние версии находятся в «mysql», поэтому, если вам не нужна предыдущая версия, вы просто захотите установить mysql с флагом «community».