Если я сбегу letsencrypt --apache, он выйдет из строя, жалуясь, что пять доменов на моем маленьком сервере вышли из строя из-за тайм-аутов. Однако все пять доменов отключены (a2dissite fake.example.net). Почему Let's Encrypt вообще пытается их защитить? (Это ошибка?) Могу ли я как-нибудь указать ему пропускать отключенные сайты вместо того, чтобы снимать их выбор вручную?
Apache на сервере Ubuntu 16.04.3 LTS (xenial).
При первом запуске letsencrypt (или certbot) создается новый файл конфигурации для каждого сайта, настроенного и включенного на сервере. Это означает example.net.conf дополняется example.net-le-ssl.conf. Если вы хотите отключить сайт, теперь вам нужно отключить обе файлы конфигурации.
a2dissite example.net
a2dissite example.net-le-ssl
(При желании добавить .conf в конце обоих вышеизложенных: это не имеет значения.)
Если вы этого не сделаете, letsencypt все равно попытается обновить SSL-сертификат для рассматриваемого сайта.