В конфигурации репозитория 'base' отсутствует имя с идентификатором CentOS5

Centos 5 находится в конце жизни уже несколько месяцев. Как вы можете прочитать в http://mirror.centos.org/centos/5/readme :

Этот каталог (и версия CentOS) устарели.

CentOS-5 теперь прошёл EOL

Вы можете получить последнюю выпущенную версию centos 5.11 здесь:

http://vault.centos.org/5.11/

ВНИМАНИЕ: это не поддерживается в целях безопасности с момента перехода в Vault. У него будут проблемы с безопасностью, вместо этого вам следует перейти на новую версию.

Вы должны увидеть, существует ли файл /etc/yum.repos.d/CenOS-Base.repo

Если это так, я бы сослался на следующее, чтобы узнать, есть ли что-нибудь внутри базового файла репо, что может вызвать ошибку. В противном случае, если файл не существует, я бы создал файл с этими настройками, чтобы посмотреть, подойдет ли он для вас.

# CentOS-Base.repo
#
# This file uses a new mirrorlist system developed by Lance Davis for CentOS.
# The mirror system uses the connecting IP address of the client and the
# update status of each mirror to pick mirrors that are updated to and
# geographically close to the client.  You should use this for CentOS updates
# unless you are manually picking other mirrors.
#
# If the mirrorlist= does not work for you, as a fall back you can try the
# remarked out baseurl= line instead.
#
#

[base]
name=CentOS-$releasever - Base
mirrorlist=http://mirrorlist.centos.org/?release=5&arch=$basearch&repo=os
baseurl=http://mirror.centos.org/centos/$releasever/os/$basearch/
gpgcheck=1
gpgkey=http://mirror.centos.org/centos/RPM-GPG-KEY-CentOS-5

#released updates
[updates]
name=CentOS-$releasever - Updates
mirrorlist=http://mirrorlist.centos.org/?release=5&arch=$basearch&repo=updates
baseurl=http://mirror.centos.org/centos/$releasever/updates/$basearch/
gpgcheck=1
gpgkey=http://mirror.centos.org/centos/RPM-GPG-KEY-CentOS-5
#additional packages that may be useful

[extras]
name=CentOS-$releasever - Extras
mirrorlist=http://mirrorlist.centos.org/?release=5&arch=$basearch&repo=extras
baseurl=http://mirror.centos.org/centos/$releasever/extras/$basearch/
gpgcheck=1
gpgkey=http://mirror.centos.org/centos/RPM-GPG-KEY-CentOS-5

[centosplus]
name=CentOS-$releasever - Plus
mirrorlist=http://mirrorlist.centos.org/?release=$releasever&arch=$basearch&rep$
baseurl=http://mirror.centos.org/centos/$releasever/centosplus/$basearch/
gpgcheck=1
enabled=0
gpgkey=http://mirror.centos.org/centos/RPM-GPG-KEY-CentOS-5

[dag]
name=Dag RPM Repository for Centos
baseurl=http://apt.sw.be/redhat/el$releasever/en/$basearch/dag

[addons]
name=CentOS-$releasever - Addons
mirrorlist=http://mirrorlist.centos.org/?release=5&arch=$basearch&repo=addons
baseurl=http://mirror.centos.org/centos/$releasever/addons/$basearch/
gpgcheck=1
gpgkey=http://mirror.centos.org/centos/RPM-GPG-KEY-CentOS-5
enabled=1

Я бы также дважды проверил ваш ключ GPG http://www.cyberciti.biz/faq/redhat-centos-linux-verify-rhn-rhn-repo-package-gpg-keys/