Проблема с сервером, базой данных или кодом? Бэкэнд Magento переписывается с помощью index.php, который не работает

Я буду честен и признаю свою перекрестную публикацию на magento.stackexchange.com, но причина в том, что я считаю, что это ошибка сервера, и теперь я ищу доказательства, чтобы представить их моим ужасным хостинг-провайдерам, GoDaddy ...

Мой magento неожиданно заработал мечту при входе в

mysite.com/mixitup/ 

после входа в систему он меняется на

mysite.com/index.php/mixitup/dashboard/index/key/812b0641da.... etc, 

однако если я изменю путь на

mysite.com/mixitup/dashboard/index/key/812b0641da... etc 

затем отображается панель инструментов, но при нажатии на что-нибудь, например каталог> управление продуктами, index.php вставляется снова, оставляя

mysite.com/index.php/mixitup/catalog_product/index/key/f0e2d249eca781e... etc

Как ни странно, это внезапно повлияло на 2 независимых сайта magento на одном сервере. Они совместно используют файл .htaccess на маршруте, однако это не изменилось, чтобы вызвать проблему. Это общий сервер godaddy, поэтому мои возможности здесь ограничены.

Есть мысли о том, что могло это изменить? или как исправить?

Вот копия моего файла .htaccess (извините за сброс)

############################################
## uncomment these lines for CGI mode
## make sure to specify the correct cgi php binary file name
## it might be /cgi-bin/php-cgi

#    Action php5-cgi /cgi-bin/php5-cgi
#    AddHandler php5-cgi .php

############################################
## GoDaddy specific options

Options -MultiViews

## you might also need to add this line to php.ini
##     cgi.fix_pathinfo = 1
## if it still doesn't work, rename php.ini to php5.ini

############################################
## this line is specific for 1and1 hosting

#AddType x-mapp-php5 .php
#AddHandler x-mapp-php5 .php

############################################
## default index file

DirectoryIndex index.php index.html

<IfModule mod_php5.c>

############################################
## adjust memory limit

#    php_value memory_limit 64M
php_value memory_limit 128M
php_value max_execution_time 18000

############################################
## disable magic quotes for php request vars

php_flag magic_quotes_gpc off

############################################
## disable automatic session start
## before autoload was initialized

php_flag session.auto_start off

############################################
## enable resulting html compression

#php_flag zlib.output_compression on

###########################################
# disable user agent verification to not break multiple image upload

php_flag suhosin.session.cryptua off

###########################################
# turn off compatibility with PHP4 when dealing with objects

php_flag zend.ze1_compatibility_mode Off

</IfModule>

<IfModule mod_security.c>
###########################################
# disable POST processing to not break multiple image upload

SecFilterEngine Off
SecFilterScanPOST Off
</IfModule>

<IfModule mod_deflate.c>

############################################
## enable apache served files compression
## http://developer.yahoo.com/performance/rules.html#gzip

# Insert filter on all content
###SetOutputFilter DEFLATE
# Insert filter on selected content types only
#AddOutputFilterByType DEFLATE text/html text/plain text/xml text/css text/javascript

# Netscape 4.x has some problems...
#BrowserMatch ^Mozilla/4 gzip-only-text/html

# Netscape 4.06-4.08 have some more problems
#BrowserMatch ^Mozilla/4\.0[678] no-gzip

# MSIE masquerades as Netscape, but it is fine
#BrowserMatch \bMSIE !no-gzip !gzip-only-text/html

# Don't compress images
#SetEnvIfNoCase Request_URI \.(?:gif|jpe?g|png)$ no-gzip dont-vary

# Make sure proxies don't deliver the wrong content
#Header append Vary User-Agent env=!dont-vary

</IfModule>

<IfModule mod_ssl.c>

############################################
## make HTTPS env vars available for CGI mode

SSLOptions StdEnvVars

</IfModule>

<IfModule mod_rewrite.c>

############################################
## enable rewrites

Options +FollowSymLinks
RewriteEngine on

############################################
## you can put here your magento root folder
## path relative to web root

RewriteBase /

############################################
## workaround for HTTP authorization
## in CGI environment

RewriteRule .* - [E=HTTP_AUTHORIZATION:%{HTTP:Authorization}]

############################################
## always send 404 on missing files in these folders

RewriteCond %{REQUEST_URI} !^/(media|skin|js)/

############################################
## never rewrite for existing files, directories and links

RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-l

############################################
## rewrite everything else to index.php

RewriteRule .* index.php [L]

</IfModule>


############################################
## Prevent character encoding issues from server overrides
## If you still have problems, use the second line instead

AddDefaultCharset Off
#AddDefaultCharset UTF-8

<IfModule mod_expires.c>

############################################
## Add default Expires header
## http://developer.yahoo.com/performance/rules.html#expires

ExpiresDefault "access plus 1 year"

</IfModule>

############################################
## By default allow all access

Order allow,deny
Allow from all

############################################
## If running in cluster environment, uncomment this
## http://developer.yahoo.com/performance/rules.html#etags

#FileETag none

ЧТО Я ТАКЖЕ ПРОВЕРИЛ

Я только что попытался восстановить резервную копию базы данных и данных за последний понедельник, и мне не повезло ... поэтому могу ли я предположить, что это изменение конфигурации сервера? Как его обработка URL перезаписывается? Mod_Rewrites? или сам файл .htaccess?

Генри