Есть ли какие-либо подводные камни или ошибки для репликации (главный-> подчиненный) MySQL DB на удаленный сервер на расстоянии 100 мс от пинга?
Тонны в зависимости от того, что вы хотите сделать и какие функции вы используете. В документации указаны наиболее распространенные вещи, о которых вам следует знать; особенно раздел «особенности и проблемы».