MySQL, поставляемый с Ubuntu 10.04.2, - это 5.1.41, который распространяется MySQL с InnoDB 1.0.5. Но по некоторым причинам Ubuntu поставляет его с InnoDB 1.0.
Могу ли я установить InnoDB 1.0.5 (или новее?)
Вам нужно будет собрать mysql из исходного кода. Инструкции для вашего конкретного дистрибутива можно найти в Google, на сайте mysql также будет общая информация об установке Linux.