$TTL 86400
$ORIGIN yoda.domain2.com.
@ 1D IN SOA yoda.domain2.com. admin.domain.com. (
2015021601 ; Serial yyyymmddnn
3h ; Refresh After 3 hours
1h ; Retry Retry after 1 hour
1w ; Expire after 1 week 1w
1h) ; Minimum negative caching of 1 hour
IN NS yoda.domain2.com.
IN NS r2d2.domain2.com.
domain.com. IN TXT v=spf1 mx a:r2d2.domain2.com ~all
domain.com. MX 0 r2d2.domain2.com.
domain.com. IN A 108.61.175.20
www.domain.com. IN A 108.61.175.20
mail.domain.com. IN A 107.191.60.48
imap.domain.com. IN A 107.191.60.48
pop.domain.com. IN A 107.191.60.48
smtp.domain.com. IN A 107.191.60.48
yoda.domain.com. IN A 108.61.190.64
r2d2.domain.com. IN A 107.191.60.48
vader.domain.com IN A 108.61.175.20
r2d2.domain.com. IN AAAA 2001:19f0:7000:8945::64
yoda.domain.com. IN AAAA 2001:19f0:6c00:8141::64
$include /usr/local/etc/namedb/Kdomain.com.zsk.key ; ZSK
$include /usr/local/etc/namedb/Kdomain.com.ksk.key ; KSK
В SOA запись находится на yoda.ex-mailer.com ($ORIGIN yoda.ex-mailer.com. переопределяет происхождение к этому).
Однако остальная часть файла зоны, похоже, содержит nyctelecomm.com. записи. Кроме того, вы указываете исходное происхождение для dnssec-signzone так как nyctelecomm.com.
Кажется, это несоответствие, которое приведет к такой ошибке. (The SOA и NS записи должны быть на вершине зоны.)
Хотя проблема с этим файлом зоны на самом деле не связана с DNSSEC как таковая, вы можете изучить auto-dnssec maintain функциональность современных версий BIND в качестве альтернативы подписанию вручную с помощью dnssec-signzone.