Хотите выполнить это в MySQL 5.0:
установить global log_warnings = 2;
Сохранится ли настройка после перезапуска службы mysqld?
Нет. Переменную можно включить в файле опций my.cnf, иначе после перезапуска она будет сброшена до значения по умолчанию. 1