У меня есть сервер Ubuntu с подключенным хранилищем SAN. Он имеет размер 770 ГБ, использует 197 МБ и сообщает только о 731 ГБ свободного места.
df -hl Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on /dev/mapper/data 770G 197M 731G 1% /data/mysql
Вероятно, он зарезервирован для root - mkfs.ext3 делает это (резервирует 5% блоков) с настройками по умолчанию.
Попробуйте это, если вы используете ext3:
tune2fs -m 0 /dev/mapper/data
Для получения дополнительной информации и объяснения этого поведения по умолчанию см. man tune2fs.