У меня уже есть выделенный сервер с кучей всего. По сути, сейчас я получаю к нему доступ с бесплатным доменом, который получил при покупке сервера (http://example.com/directory, и т.д).
У меня также есть второй домен, который я хочу использовать с определенным подкаталогом (http://exampletwo.com/ должен работать, как если бы я был под http://example.com/two, но он должен использовать домен exampletwo.
Я бы предположил, что поменяю запись A второго домена на IP-адрес сервера, но как мне заставить ее работать с подкаталогом? У меня есть полный DNS-контроль над вторым доменом, но он приобретен у другого регистратора, чем у выделенного сервера.
как мне заставить его работать с подкаталогом?
Использовать Перенаправление HTTP/переписать или виртуальный хост.
Настройки зависят от веб-сервера.