Можно ли разделить локальный каталог (не svn checkout) и удаленный svn-репозиторий без предварительной проверки репозитория в другой локальный каталог?
Мне он нужен для linux (debian) но вопрос в общем.
Нет. svn diff не могут использовать нерелевантные пути или URL-адреса в качестве параметров, они должны быть частью репозитория или рабочей копии.
Но вы можете получить пустой WC из того же корня, что и корень вашего дерева каталогов, добавить дерево из инверсированного пути в этот WC и сравнить (измененный WC vs URL). Прочитать о --depth и --set-depth варианты также