Назад | Перейти на главную страницу

Усиление интенсивной записи ZFS из-за фрагментации свободного пространства

Я установил ZFS RAID0 для базы данных PostgreSQL. Хранилище и инстансы находятся в томах AWS EC2 и EBS.

NAME   SIZE  ALLOC   FREE  EXPANDSZ   FRAG    CAP  DEDUP  HEALTH  ALTROOT
pgpool   479G   289G   190G         -    70%    60%  1.00x  ONLINE  -
  xvdf  59.9G  36.6G  23.3G         -    71%    61%
  xvdg  59.9G  34.7G  25.2G         -    70%    57%
  xvdh  59.9G  35.7G  24.2G         -    71%    59%
  xvdi  59.9G  35.7G  24.2G         -    71%    59%
  xvdj  59.9G  36.3G  23.6G         -    71%    60%
  xvdk  59.9G  36.5G  23.4G         -    71%    60%
  xvdl  59.9G  36.6G  23.3G         -    71%    61%
  xvdm  59.9G  36.6G  23.2G         -    71%    61%

Ранее FRAG составляет 80% на большинстве устройств, и у нас наблюдается большое количество операций ввода-вывода в секунду при записи. Поскольку емкость пула ранее была загружена на 75% (400 ГБ), для каждого устройства были выделены дополнительные 10 ГБ (400 ГБ + 80 ГБ). Сейчас FRAG снижается до 70%. Одним из важных показателей является то, что IOPS при записи сейчас намного меньше для той же рабочей нагрузки.

Согласно метрикам Cloudwatch после увеличения размера EBS, количество операций ввода-вывода в секунду при записи резко снизилось до 1200 - 1400 операций ввода-вывода в секунду с 4000 операций ввода-вывода в секунду для Master PG и до 600 операций ввода-вывода в секунду с 3000 операций ввода-вывода в секунду для ведомого PG. Я подозревал, что это связано с тем, как FRAG усиливает записи, как описано в этом ответ.

Мы установили recordsize=128K как compressratio намного лучше чем recordsize=8K. Я думаю в связи с высшим recordsize, FRAG быстро увеличивается и приводит к усилению записи и большому количеству операций ввода-вывода в секунду при записи. Не предотвратит ли уменьшение размера записи усиление записи или любую другую проблему, которую мне не хватает?

Информация о базе данных

PostgreSQL 9.6
Checkpoint Timeout: 10min
Total Databases: ~1100
Tables / DB: ~1300
Files / DB: ~6000 to 8000 (1300 Tables + Indexes + Toast)
Total Files for All DBs: ~7.7m

В среднем за каждые 5 минут будут затронуты от ~ 60000 до 70000 файлов (таблицы + индексы + тосты) (согласно журналу завершения контрольной точки postgres). Значит, нужно делать какие-то настройки относительно огромного количества файлов? Или, по крайней мере, я надеюсь, почему такая резкая разница в IOPS при добавлении дополнительного места в пул?

Также я видел такую ​​же разницу в IOPS месяц назад, когда в пул добавлялось дополнительное пространство, но возвращался к высокой скорости IOPS через два дня. Полагаю, то же самое может повториться через два-три дня, и поэтому я подозреваю фрагментацию свободного пространства. FRAG будет виноватым .. !!

ZPOOL Реквизит

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ sudo zpool get all
NAME    PROPERTY                       VALUE                          SOURCE
pgpool  size                           479G                           -
pgpool  capacity                       60%                            -
pgpool  altroot                        -                              default
pgpool  health                         ONLINE                         -
pgpool  guid                           1565875598252756833            -
pgpool  version                        -                              default
pgpool  bootfs                         -                              default
pgpool  delegation                     on                             default
pgpool  autoreplace                    off                            default
pgpool  cachefile                      -                              default
pgpool  failmode                       wait                           default
pgpool  listsnapshots                  off                            default
pgpool  autoexpand                     on                             local
pgpool  dedupditto                     0                              default
pgpool  dedupratio                     1.00x                          -
pgpool  free                           190G                           -
pgpool  allocated                      289G                           -
pgpool  readonly                       off                            -
pgpool  ashift                         0                              default
pgpool  comment                        -                              default
pgpool  expandsize                     -                              -
pgpool  freeing                        0                              -
pgpool  fragmentation                  71%                            -
pgpool  leaked                         0                              -
pgpool  multihost                      off                            default
pgpool  feature@async_destroy          enabled                        local
pgpool  feature@empty_bpobj            enabled                        local
pgpool  feature@lz4_compress           active                         local
pgpool  feature@multi_vdev_crash_dump  enabled                        local
pgpool  feature@spacemap_histogram     active                         local
pgpool  feature@enabled_txg            active                         local
pgpool  feature@hole_birth             active                         local
pgpool  feature@extensible_dataset     active                         local
pgpool  feature@embedded_data          active                         local
pgpool  feature@bookmarks              enabled                        local
pgpool  feature@filesystem_limits      enabled                        local
pgpool  feature@large_blocks           enabled                        local
pgpool  feature@large_dnode            enabled                        local
pgpool  feature@sha512                 enabled                        local
pgpool  feature@skein                  enabled                        local
pgpool  feature@edonr                  enabled                        local
pgpool  feature@userobj_accounting     active                         local

ZFS Реквизит

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ sudo zfs get all
NAME    PROPERTY              VALUE                  SOURCE
pgpool  type                  filesystem             -
pgpool  creation              Mon Oct  8 18:45 2018  -
pgpool  used                  289G                   -
pgpool  available             175G                   -
pgpool  referenced            288G                   -
pgpool  compressratio         5.06x                  -
pgpool  mounted               yes                    -
pgpool  quota                 none                   default
pgpool  reservation           none                   default
pgpool  recordsize            128K                   default
pgpool  mountpoint            /mnt/PGPOOL            local
pgpool  sharenfs              off                    default
pgpool  checksum              on                     default
pgpool  compression           lz4                    local
pgpool  atime                 off                    local
pgpool  devices               on                     default
pgpool  exec                  on                     default
pgpool  setuid                on                     default
pgpool  readonly              off                    default
pgpool  zoned                 off                    default
pgpool  snapdir               hidden                 default
pgpool  aclinherit            restricted             default
pgpool  createtxg             1                      -
pgpool  canmount              on                     default
pgpool  xattr                 sa                     local
pgpool  copies                1                      default
pgpool  version               5                      -
pgpool  utf8only              off                    -
pgpool  normalization         none                   -
pgpool  casesensitivity       sensitive              -
pgpool  vscan                 off                    default
pgpool  nbmand                off                    default
pgpool  sharesmb              off                    default
pgpool  refquota              none                   default
pgpool  refreservation        none                   default
pgpool  guid                  571000568545391306     -
pgpool  primarycache          all                    default
pgpool  secondarycache        all                    default
pgpool  usedbysnapshots       0B                     -
pgpool  usedbydataset         288G                   -
pgpool  usedbychildren        364M                   -
pgpool  usedbyrefreservation  0B                     -
pgpool  logbias               throughput             local
pgpool  dedup                 off                    default
pgpool  mlslabel              none                   default
pgpool  sync                  standard               default
pgpool  dnodesize             legacy                 default
pgpool  refcompressratio      5.07x                  -
pgpool  written               288G                   -
pgpool  logicalused           1.42T                  -
pgpool  logicalreferenced     1.42T                  -
pgpool  volmode               default                default
pgpool  filesystem_limit      none                   default
pgpool  snapshot_limit        none                   default
pgpool  filesystem_count      none                   default
pgpool  snapshot_count        none                   default
pgpool  snapdev               hidden                 default
pgpool  acltype               off                    default
pgpool  context               none                   default
pgpool  fscontext             none                   default
pgpool  defcontext            none                   default
pgpool  rootcontext           none                   default
pgpool  relatime              off                    default
pgpool  redundant_metadata    most                   local
pgpool  overlay               off                    default

ARC

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ cat /proc/spl/kstat/zfs/arcstats
13 1 0x01 96 4608 8003814189 8133508755293587
name                            type data
hits                            4    48883641586
misses                          4    1321425301
demand_data_hits                4    15606800719
demand_data_misses              4    786648720
demand_metadata_hits            4    32729793033
demand_metadata_misses          4    278006868
prefetch_data_hits              4    315020107
prefetch_data_misses            4    207366277
prefetch_metadata_hits          4    232027727
prefetch_metadata_misses        4    49403436
mru_hits                        4    10685966527
mru_ghost_hits                  4    85159850
mfu_hits                        4    37807765384
mfu_ghost_hits                  4    40046050
deleted                         4    960331018
mutex_miss                      4    15489677
access_skip                     4    17626
evict_skip                      4    21812713742
evict_not_enough                4    267500438
evict_l2_cached                 4    0
evict_l2_eligible               4    108797848903680
evict_l2_ineligible             4    2000957528064
evict_l2_skip                   4    0
hash_elements                   4    313401
hash_elements_max               4    769926
hash_collisions                 4    587807552
hash_chains                     4    11108
hash_chain_max                  4    6
p                               4    3794526616
c                               4    7022898344
c_min                           4    1004520576
c_max                           4    16072329216
size                            4    6944858120
compressed_size                 4    3732648960
uncompressed_size               4    20043857408
overhead_size                   4    1682603008
hdr_size                        4    110128312
data_size                       4    3359916544
metadata_size                   4    2055335424
dbuf_size                       4    246193488
dnode_size                      4    943126912
bonus_size                      4    230157440
anon_size                       4    33360384
anon_evictable_data             4    0
anon_evictable_metadata         4    0
mru_size                        4    3718656000
mru_evictable_data              4    1940126208
mru_evictable_metadata          4    224441856
mru_ghost_size                  4    1684268032
mru_ghost_evictable_data        4    0
mru_ghost_evictable_metadata    4    1684268032
mfu_size                        4    1663235584
mfu_evictable_data              4    1288254464
mfu_evictable_metadata          4    83499008
mfu_ghost_size                  4    1506922496
mfu_ghost_evictable_data        4    1391591424
mfu_ghost_evictable_metadata    4    115331072
l2_hits                         4    0
l2_misses                       4    0
l2_feeds                        4    0
l2_rw_clash                     4    0
l2_read_bytes                   4    0
l2_write_bytes                  4    0
l2_writes_sent                  4    0
l2_writes_done                  4    0
l2_writes_error                 4    0
l2_writes_lock_retry            4    0
l2_evict_lock_retry             4    0
l2_evict_reading                4    0
l2_evict_l1cached               4    0
l2_free_on_write                4    0
l2_abort_lowmem                 4    0
l2_cksum_bad                    4    0
l2_io_error                     4    0
l2_size                         4    0
l2_asize                        4    0
l2_hdr_size                     4    0
memory_throttle_count           4    0
memory_direct_count             4    3209752
memory_indirect_count           4    15181019
memory_all_bytes                4    32144658432
memory_free_bytes               4    6916120576
memory_available_bytes          3    6413860864
arc_no_grow                     4    0
arc_tempreserve                 4    0
arc_loaned_bytes                4    0
arc_prune                       4    252427
arc_meta_used                   4    3584941576
arc_meta_limit                  4    12054246912
arc_dnode_limit                 4    1205424691
arc_meta_max                    4    12420274128
arc_meta_min                    4    16777216
sync_wait_for_async             4    4231322
demand_hit_predictive_prefetch  4    195199007
arc_need_free                   4    0
arc_sys_free                    4    502260288

zdb -C

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ sudo zdb -C pgpool

MOS Configuration:
        version: 5000
        name: 'pgpool'
        state: 0
        txg: 4739409
        pool_guid: 1565875598252756833
        errata: 0
        hostname: 'ip-10-0-1-59'
        com.delphix:has_per_vdev_zaps
        vdev_children: 8
        vdev_tree:
            type: 'root'
            id: 0
            guid: 1565875598252756833
            create_txg: 4
            children[0]:
                type: 'disk'
                id: 0
                guid: 1507251152420866879
                path: '/dev/xvdf1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 64
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1425
                create_txg: 4
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 129
                com.delphix:vdev_zap_top: 130
            children[1]:
                type: 'disk'
                id: 1
                guid: 12461793154748882472
                path: '/dev/xvdg1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 68
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1424
                create_txg: 9
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 131
                com.delphix:vdev_zap_top: 132
            children[2]:
                type: 'disk'
                id: 2
                guid: 15169312858460766498
                path: '/dev/xvdh1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 69
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1427
                create_txg: 12
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 133
                com.delphix:vdev_zap_top: 134
            children[3]:
                type: 'disk'
                id: 3
                guid: 8533762672700299025
                path: '/dev/xvdi1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 74
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1422
                create_txg: 15
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 71
                com.delphix:vdev_zap_top: 72
            children[4]:
                type: 'disk'
                id: 4
                guid: 6612366135198079494
                path: '/dev/xvdj1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 139
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1428
                create_txg: 18
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 136
                com.delphix:vdev_zap_top: 137
            children[5]:
                type: 'disk'
                id: 5
                guid: 15947515837120747219
                path: '/dev/xvdk1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 142
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1421
                create_txg: 21
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 140
                com.delphix:vdev_zap_top: 141
            children[6]:
                type: 'disk'
                id: 6
                guid: 15626684534009192025
                path: '/dev/xvdl1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 146
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1426
                create_txg: 24
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 143
                com.delphix:vdev_zap_top: 144
            children[7]:
                type: 'disk'
                id: 7
                guid: 19815078749163274
                path: '/dev/xvdm1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 149
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1423
                create_txg: 27
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 147
                com.delphix:vdev_zap_top: 148
        features_for_read:
            com.delphix:hole_birth
            com.delphix:embedded_data

zfs.conf

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ sudo cat /etc/modprobe.d/zfs.conf
options zfs zfs_arc_max=77147180237

zdb metaslabs и spacemap

zdb -m / -mm / -mmm

Из метаслабок и информации о космической карте, похоже, что метаслабки и космические карты в конце каждого vdev имеют много свободного места (из-за последнего увеличения размера) по сравнению с верхними областями. Итак, это коррелирует с объясненной проблемой. Вот как снижение производительности при фрагментировании метаслаб и spacemap.

Я думаю, что лучше добавить зеркала и удалить старые vdev, чтобы продвигать новые устройства как основные. Это поможет метаслабам и пространственной карте, как будто это свежий пул без особой фрагментации (??? не уверен !!!). В любом случае, это будет использоваться в крайнем случае, до тех пор я займусь проверкой природы проблемы и любыми настройками, необходимыми для метаслабок / карты пространства со стороны zfs.

Также, чтобы уменьшить фрагментацию, планировалось добавить устройство журнала zfs на отдельное устройство и переместить каталог postgres pg_xlog на отдельное устройство с разделом ext4.

Без глубокой отладки сложно дать вам однозначный ответ. В любом случае, следует отметить следующие моменты:

  • ZFS выделяет блоки через космические карты. Когда карта пространства заполнена> = 96% (80% для более старой сборки), ZFS переключится с первого на наиболее подходящий распределитель. Обратите внимание, что это решение для каждой карты пространства: вы можете иметь пул, заполненный на 80%, с некоторыми картами пространств, значительно превышающими это значение, возможно, уже более 96%. При записи в такие карты пространства ZFS будет использовать более медленный и наиболее подходящий распределитель.

  • фрагментированная карта пространства будет использовать гораздо больше памяти, чем нефрагментированная. Это дополнительное давление на память может привести к уничтожение космической карты. Вы можете избежать этого, установив metaslab_debug_load=1; если это не сработает, попробуйте повторно импортировать пул и / или настройку metaslab_debug_unload=1. Обратите внимание, что постоянная блокировка всех пространственных карт в памяти неизбежно потребляет больше оперативной памяти.

  • ты мог быть сожжен блоки банды но, опять же, без дальнейшей отладки трудно сказать, так ли это. Конечно, размер записи 128К, при таком хорошем compressratio, не делает вам одолжений в отношении фрагментации. Вы можете прочитать дополнительную информацию Вот и Вот.

Боковое примечание: я вижу, что в вашем бассейне ashift=9. Я думаю, что чистые 512B устройства сейчас довольно редки, особенно в облачной среде. В попытке повысить производительность вы можете / воссоздадите свой пул с помощью ashift=12.