Инструмент Iotop сообщает, что md2_raid1 занимает HDD IO до 99%. Жесткий диск сервера становится загруженным, и с ним невозможно выполнять какие-либо операции.
Вот результат cat /proc/mdstat:
Personalities : [raid0] [raid1] [raid6] [raid5] [raid4] [raid10]
md2 : active raid1 sda3[0] sdb3[1]
1462766336 blocks [2/2] [UU]
md1 : active raid1 sda2[0] sdb2[1]
264960 blocks [2/2] [UU]
md0 : active raid1 sda1[0] sdb1[1]
2102464 blocks [2/2] [UU]
unused devices: <none>
Похоже, что один из ваших жестких дисков вышел из строя. проверьте значения SMART, проверьте его с помощью низкоуровневых утилит, например MHDD или Victoria, или замените на новый и посмотрите, поможет ли.