Как мне настроить IIS, чтобы клиенты могли программно загружать файлы в папку на сервере?
Вам понадобится какое-то приложение в IIS для получения байтового потока. Вы можете использовать веб-службы для этого типа передачи файлов. Затем ваш уровень обслуживания должен будет сохранить их в желаемом месте. Также вам потребуется, чтобы эта папка имела доступ для записи и, скорее всего, работала в режиме полного доверия. Вы можете проверить это приложение и посмотреть, как он это делает в Silverlight, на странице asp.net. http://www.michielpost.nl/Silverlight/MultiFileUploader/
Вам придется написать код, чтобы сделать это за вас. Тим привел пример для страницы .NET.
Если вы используете общий хостинг, ваш хостинг-провайдер может предоставить компоненты COM +, которые вы можете вызывать со страниц ASP, таких как AspUpload или SaFileUp.