Я использую Torque и хочу, чтобы мой журнал PBS + вывод ошибок добавлялся к предыдущему файлу журнала / ошибки, а не перезаписывал его.
Вам нужно сделать это как отдельный шаг в сценарии задания.
cd $PBS_O_WORKDIR
mkdir $PBS_JOBID
mycode 1> $PBS_JOBID/myoutput.out 2> $PBS_JOBID/myerror.err
cat $PBS_JOBID/myoutput.out >> previouslogoutput.out