У нас установлен suEXEC, и мы также используем контроль версий git.
suEXEC позволяет запускать сценарии cgi только с разрешением 755. Git устанавливает права доступа к файлам для сценариев cgi (и всех исполняемых файлов) равными 775.
Есть ли способ настроить suEXEC так, чтобы скрипты cgi могли запускаться с разрешением 775?
Не безопасно, нет. Я бы исправил ваши настройки git, чтобы не изменять разрешения.