Apache2 Graceful загружает разные php.ini

У меня есть сервер Apache, на котором запущен Apache / mod_php.

При новом запуске и при использовании sudo service apache2 restart загружается правильный файл php.ini:

Выполнение изящной перезагрузки apache, т.е. "sudo service apache2 graceful", приводит к тому, что php загружает другой файл php.ini (который не существует в файловой системе):

Что может быть причиной этого и какие-либо идеи о том, как его решить?