После установки синхронизации Office 365 AD, как указано в Office 365, вы можете столкнуться с ошибками WMI на своем сервере, а также с множеством других ошибок. Эта проблема сводила меня с ума на нескольких клиентских серверах за последние пару недель. Они могут включать ошибку 1603 при установке, ошибки установки SQL Server Express, ошибки установки Microsoft Sign-In Assistant и многое другое.
Решение на самом деле очень простое. Используйте Azure Active Directory Sync - новый инструмент от Microsoft (https://azure.microsoft.com/en-us/documentation/articles/active-directory-aadconnect/)
С его помощью проблемы исчезнут, и он без проблем синхронизируется с Office 365 напрямую. Не используйте руководство, находящееся в Office 365.