Апт без запроса ночью удалить некоторые пакеты

Сегодня я пришел на работу и обнаружил, что некоторые из моих скриптов perl на рабочем сервере - не запускаются. Проблема в том, что скрипты не могут найти некоторые библиотеки, которые должны работать. Однако буквально вчера эти библиотеки были установлены и скрипты заработали! Похоже, пакеты удалены из системы! После просмотра журналов я нашел эту запись в /var/log/apt/history.log

Дата начала: 26.09.2014 06:10:33 Удаление: libclass-load-perl: amd64 (0.17-1), rrdtool: amd64 (1.4.7-2), libyaml-syck-perl: amd64 (1.20- 1), ... ПРОПУСТИТЕ ДРУГИЕ БОЛЬШИНСТВО ПАКЕТОВ Perl Дата окончания: 2014-09-26 06:10:41

НО!

1 На сервере в это время никого не было, и никто не мог удалить эти пакеты.

2.Возможно, сервер был взломан, но сначала явных признаков взлома не видно, а во-вторых очень странно, что злоумышленник решил удалить эти пакеты

3 Все остальные записи в /var/log/apt/history.log - также имеют другую строку CommandLine: - и в данном случае ее нет.

Что могло случиться?

ОБНОВИТЬ:

За неделю до этого (19.09.2014) я удалил мунин (но не мунин-узел!). Может быть, этот удаленный пакет является предложением автоматического удаления для munin? Но, как я знаю, «автоматическое удаление» на самом деле не «автоматическое», и перед удалением чего-либо требуется ручная проверка.

ОБНОВЛЕНИЕ2:

1. unattended-upgrade - не установлен
2. /etc/apt/apt.conf.d/01autoremove

APT
{
  NeverAutoRemove
  {
        "^firmware-linux.*";
        "^linux-firmware$";
        "^linux-image.*";
        "^kfreebsd-image.*";
        "^linux-restricted-modules.*";
        "^linux-ubuntu-modules-.*";
        "^gnumach$";
        "^gnumach-image.*";
  };

  Never-MarkAuto-Sections
  {
        "metapackages";
        "restricted/metapackages";
        "universe/metapackages";
        "multiverse/metapackages";
        "oldlibs";
        "restricted/oldlibs";
        "universe/oldlibs";
        "multiverse/oldlibs";
  };
};