У меня стандартный mediatemple VPS
В настоящее время он запускает простой небольшой веб-сайт с примерно 100 (пиковое 171) посещением в день, но использование памяти сервера постоянно сокращается.
Это нормальное поведение, если нет, как мне найти виновника, или у меня просто недостаточно оперативной памяти?
Для нескольких сотен запросов в день вы не должны видеть проблем с памятью - или вообще каких-либо проблем.
Скорее всего, это утечка памяти из-за плохих PHP-скриптов и невозможность перезапуска рабочих процессов.
Если при этом запущен MPM prefork apache, установите MaxrequestsPerChild равным 10 или около того и посмотрите, какой эффект это даст.