у меня есть Samba 3.5.11 on Debian/kfreebsd sid. (Также тестировалось с 3.6.1 из экспериментальной)
У меня файловая система zfs Storage/Photos.
Если я открою одну из папок там (Storage/Photos/folder1) он показывает (в Windows 7, Total Commander):
Итак, я вижу один и тот же файл несколько раз в Total Commander (а также в проводнике Windows).
Иногда Thumbs.db выходит 20-30 штук.
Не знаю с чего начать, в чем может быть проблема?
Сначала проверьте это на более простом клиенте.
В окне Debian запустите
smbclient //server/share
Введите учетные данные и запустите
ls /your/directory
Также внимательно изучите свои журналы.