Я получаю предупреждение об устаревании, несмотря на следующие настройки в /etc/php5/apache2/php.ini
Я не вижу специфичного для интерфейса командной строки php.ini. Нужно ли мне его создать? Откуда еще взялся бы этот параметр?
error_reporting = E_ALL & ~E_NOTICE & ~E_DEPRECATED
Какая раздача?
/etc/php5/apache2/php.ini - попробуйте /etc/php5/cli/php.ini, если он присутствует, или попробуйте из оболочки #php -i | grep php.ini и отредактируйте этот файл.
Проверьте Документация PHP о файлах конфигурации.
В Gentoo Linux конфигурация CLI PHP находится под /etc/php/cli-php5.