Я перезапускаю clamav, просматриваю логи и вижу это
Mon Jan 11 11:14:49 2010 -> +++ Started at Mon Jan 11 11:14:49 2010
Mon Jan 11 11:14:49 2010 -> clamd daemon 0.90.1 (OS: linux-gnu, ARCH: i386, CPU: i486)
Mon Jan 11 11:14:49 2010 -> Log file size limit disabled.
Mon Jan 11 11:14:49 2010 -> Reading databases from /var/lib/clamav
кажется, что clamav не дочитает базу данных. Есть другие записи в журнале, и кажется, что чтение базы данных занимает до 6 часов (!). Также clamav занимает большую часть процессора.
Это известная проблема со старыми версиями clamav, попробуйте обновить clamav до последней версии (0.95.3)
Цитата с clamav.net
Все выпуски ClamAV старше 0.95 подвержены ошибке в freshclam, которая не позволяет инкрементным обновлениям работать с сигнатурами длиной более 980 байт.