Проблема с конфигурацией сокета MySQL в my.cnf

У меня проблема, которая вызывает очень долгое "время в базе данных" в моем приложении.

БД - Percona MySQL 5.5.35.

Приложение работает отлично и может нормально читать / писать из базы данных. Проблема в том, что у меня чрезвычайно долгое время отклика БД, которое определенно не тратится на выполнение запросов, которые все просты и кэшированы.

Например, я случайным образом получаю время ответа в несколько секунд, а в других случаях это занимает всего несколько миллисекунд. Настройка журналов запросов выполняется медленно, и запросы не выполняются медленно, все они просто вставки крошечных данных и около 80% операций чтения, вся БД занимает всего 20 МБ, это интернет-форум.

Я уверен, что проблема связана с сокетом, так как я не могу указать сокет в разделе mysqld файла my.cnf. В этом случае при перезапуске базы данных появляется сообщение об ошибке:

ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/var/lib/mysql/mysql.sock' (2)

Так, например, вот живая рабочая копия my.cnf с удаленными нерелевантными частями:

[mysql]

# CLIENT #
port                           = 3306
socket                         = /var/lib/mysql/mysql.sock


[mysqld]

# General #
default-storage-engine         = InnoDB

# Database replication #
server-id=1895149
log-bin=mysql-bin
log-error=mysql-bin.err
binlog_do_db=reefbase1

# MyISAM #
key-buffer-size                = 32M
myisam-recover                 = FORCE,BACKUP

Обратите внимание, что порт и сокет не указаны в разделе mysqld?

Если я изменю это на:

[mysql]

# CLIENT #
port                           = 3306
socket                         = /var/lib/mysql/mysql.sock


[mysqld]

port                           = 3306
socket                         = /var/lib/mysql/mysql.sock

# General #
default-storage-engine         = InnoDB

# Database replication #
server-id=1895149
log-bin=mysql-bin
log-error=mysql-bin.err
binlog_do_db=reefbase1

# MyISAM #
key-buffer-size                = 32M
myisam-recover                 = FORCE,BACKUP

Вот как я снова и снова вижу, что my.cnf нужно настроить, мой сервер не запускается из-за ошибки «невозможно подключиться».

Любой совет будет очень признателен.