Сервер не указывает свою версию в заголовке, так что это не поможет. Параметры управления FTP доступны в диспетчере IIS (7), и диспетчер IIS6 не установлен, поэтому я предполагаю, что это 7.0 или 7.5, но я не могу найти способ проверить это.
Поскольку FTP-сервер работает в svchost.exe, я обнаружил, что его можно определить, проверив версию следующей DLL:
C:\Windows\System32\inetsrv\ftpsvc.dll
Моя показала "Версия файла 7.5.7600.14294"