Я использую RHEL6, Python 2.6.6 и пытаюсь установить SciPy через pip.
[user@server ~]$ sudo pip install scipy
<snip>
atlas_blas_threads_info:
Setting PTATLAS=ATLAS
libraries ptf77blas,ptcblas,atlas not found in ['/usr/local/lib64', '/usr/local/lib', '/usr/lib64/atlas']
NOT AVAILABLE
<snip>
Тем не менее, когда я перечисляю файлы в / usr / lib64 / atlas:
[user@server ~]$ ls /usr/lib64/atlas
libcblas.so.3 libclapack.so.3.0 liblapack.so.3 libptcblas.so.3.0
libatlas.so.3 libcblas.so.3.0 libf77blas.so.3 liblapack.so.3.0 libptf77blas.so.3
libatlas.so.3.0 libclapack.so.3 libf77blas.so.3.0 libptcblas.so.3 libptf77blas.so.3.0
Любые идеи?
Нумпи и Сципи - странные звери. Большое раздражение - это Несоответствие Fortran ABI, среди прочего. Из страница установки:
Если ваш blas / lapack / atlas построен с использованием g77, вы должны использовать g77 при создании numpy и scipy;
Если ваш атлас построен с помощью gfortran, вы должны построить numpy / scipy с помощью gfortran.
Бегать ldd
на имеющейся у вас версии Атласа.
Если libg2c.so является зависимостью, использовался g77, и вам нужно будет передать эти параметры при сборке:
python setup.py build --fcompiler=gnu
В качестве альтернативы, если libgfortran.so является зависимостью, он был построен с помощью gfortran, и вам нужно будет установить правильный компилятор fortran:
python setup.py build --fcompiler=gnu95
В качестве примечания: если процессоры, на которых работает ваша машина, включают поддержку SIMD, я настоятельно рекомендую установить оптимизированные версии атласа (например, atlas3-sse).