Я знаю много инструментов синхронизации папок для пользователей настольных компьютеров (т.е. Windows Live Sync)
Должен ли я использовать их для синхронизации приложений между серверами или есть более корпоративное решение?
Как насчет использования DFS? Он будет реплицировать файлы между серверами (поскольку он был разработан для этого).
Как подключены ваши серверы? Вы пробовали собственный Microsoft Synctoy? Не уверен, достаточно ли он для вас "корпоративного" :) Для небольших магазинов он работает нормально.
Робокопия - еще один вариант