Если я подключаюсь через FTP, вношу изменения в файл .aspx и загружаю его, мне нужно, чтобы веб-хост выполнял какие-либо компилирования или что-то в этом роде?
Предполагая, что файл работал раньше (IIS настроен так, чтобы разрешить использование сайтов asp.net здесь), он будет автоматически перекомпилирован.
Нет. Тебе не нужно ничего делать.