У меня есть несколько хостов Server 2008 Hyper-V, которые прекрасно работают с Virtual Machine Manager. Я получил новый сервер, установил Server 2008 R2 и не смог управлять им с помощью VMM; поэтому я обновился до VMM R2. Сейчас я не могу управлять ни одной из моих старых машин Server 2008, но машина Server 2008 R2 работает отлично.
Есть ли способ использовать System Center Virtual Machine Manager в смешанной среде Server2008 / Server2008R2?
Описанная вами смешанная среда действительно является поддерживаемой средой для VMM 2008 R2 (этот FAQ перечисляет поддерживаемые платформы виртуализации).
Я бы посоветовал просмотреть шаги, описанные в это сообщение в блоге в TechNet, чтобы убедиться, что вы ничего не пропустили (в частности, обновление после обновления каждого из управляемых объектов с новым агентом).
Дополнительные сведения о процессе обновления VMM можно найти в Руководство по развертыванию VMM 2008 R2 в VMM TechNet.