Могу ли я повторно использовать SSL-сертификат для веб-сайта в IIS (работающего на порту 80) для веб-службы в том же IIS, но на порту 443
Да, все должно быть в порядке.
Сертификат упомянутый IIS, а не потребляется или заблокирован, поэтому его можно использовать в нескольких приложениях.
Когда вы выполняете свои привязки в IIS, вы сообщаете ему, какой сертификат вы хотите использовать для SSL, но он не делает исключительных требований к сертификату.