Название говорит само за себя. Есть ли параметр реестра или что-то, что помешает встроенным библиотекам Windows: WINHTTP и HTTPAPI не поддерживать SSL3?
Насколько мне известно, оба этих API используют SCHANNEL API для обеспечения своих функций SSL. Отключите SSL 3.0 в конфигурации SCHANNEL и любые приложения, использующие эти API, больше не должны поддерживать SSL 3.0. (Нет, я на самом деле это не тестировал - я просто вспоминаю об этих API.)