У меня есть экземпляр ec2 со старой версией R (3.0.2), которую я пытаюсь обновить до последней (3.1.1). Это недоступно в репозитории yum по умолчанию, но доступно в EPEL.
Установленная версия 3.0.2:
[hadoop@ip-172-31-19-15 ~]$ yum list R-core
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
970 packages excluded due to repository priority protections
Installed Packages
R-core.x86_64 3.0.2-1.17.amzn1 @amzn-main
Available Packages
R-core.i686 3.0.2-1.17.amzn1 amzn-main
Это репо
[hadoop@ip-172-31-19-15 ~]$ yum repolist
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
970 packages excluded due to repository priority protections
repo id repo name status
!amzn-main/latest amzn-main-Base 4,801
!amzn-updates/latest amzn-updates-Base 1,497
epel/x86_64 Extra Packages for Enterprise Linux 6 - x86_64 10,139+970
repolist: 16,437
Указывая репозиторий epel, я вижу версию 3.1.1, она тоже указана Вот
sudo yum --disablerepo="*" --enablerepo="epel" list R-core
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
Installed Packages
R-core.x86_64 3.0.2-1.17.amzn1 @amzn-main
Available Packages
R-core.i686 3.1.1-3.el6 epel
R-core.x86_64 3.1.1-3.el6
Однако, когда я пытаюсь установить, используя sudo yum --disablerepo="*" --enablerepo="epel" install R-core Я получаю следующие ошибки:
--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: R-java-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
Requires: java-1.5.0-gcj
Error: Package: R-core-devel-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
Requires: libicu-devel
Error: Package: R-core-devel-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
Requires: tcl-devel
Error: Package: R-core-devel-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
Requires: tk-devel
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
Requires: libicuuc.so.42()(64bit)
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
Requires: xdg-utils
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
Requires: libicui18n.so.42()(64bit)
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
Requires: libtcl8.5.so()(64bit)
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
Requires: libtk8.5.so()(64bit)
You could try using --skip-broken to work around the problem
You could try running: rpm -Va --nofiles --nodigest
Предположительно, это вызвано отключением * репо и включением только epel, что может предотвратить обнаружение некоторых зависимостей, мне пришлось сделать это, иначе он нашел бы только 3.0.2 из amzn_main.
Какую правильную команду я должен использовать для установки 3.1.1 из репозитория epel?
# yum install yum-priorities
Необходимо добавить приоритет всем настроенным репозиториям. Перейти к /etc/yum.repos.d и отредактируйте все файлы и добавьте приоритет
Чем меньше число, тем оно важнее - поэтому значения EPEL самые низкие.
Пример:
[epel]
name=Extra Packages for Enterprise Linux 6 - $basearch
#baseurl=http://download.fedoraproject.org/pub/epel/6/$basearch
mirrorlist=https://mirrors.fedoraproject.org/metalink?repo=epel-6&arch=$basearch
failovermethod=priority
enabled=1
gpgcheck=1
gpgkey=file:///etc/pki/rpm-gpg/RPM-GPG-KEY-EPEL-6
priority=10
EPEL несовместим с Amazon Linux. Раньше так было в те самые первые дни, когда Amazon Linux больше походил на CentOS, но сейчас он слишком другой.