Как мне защитить мои PHP-формы, которые обмениваются данными с моим сервером MySQL?

Это просто базовые формы, они принимают $ input из формы, а затем сохраняют его непосредственно в базе данных, есть еще одна форма, где она принимает $ input и ищет для него хешированное совпадение.

Как я могу это обезопасить?

$sql = "INSERT IGNORE INTO MD5TABLE (plaintext, hash) VALUES ('$plaintext', '$md5hash')";