У меня Cygwin и sshd работают нормально. И вообще никаких проблем при использовании шпатлевки. Он отвечает ожидаемым образом даже на несколько команд. Но при использовании phpseclib ответ приходит только на первую команду. Последующие команды дают пустой ответ. Это сценарий, который я пытаюсь выполнить -
И это вывод журнала phpseclib- http://pastebin.com/ff3sfux7
Мне удалось это решить. Решение опубликовано в моем сообщении stackoverflow -https://stackoverflow.com/questions/28250370/cygwin-openssh-server-does-not-respond-after-first-command-from-php-using-phpse/28263746#28263746